Većina obiteljskih gospodarstava u Međimurskoj županiji nema na primjeren način riješeno zbrinjavanje stajskog gnoja, koji kontinuiranim cijeđenjem i isparavanjem zagađuje okoliš, posebice podzemnu pitku vodu koja je jedan od najznačajnijih prirodnih resursa našeg kraja.

Poljoprivredna politika Europske unije posvećuje izuzetnu pozornost očuvanju prirode i okoliša. U tu svrhu osmišljeno je niz mjera kojom se poljoprivrednike obvezuje i potiče da u procesu uzgoja životinja i bilja vode računa o zaštiti prirode i okoliša. Jedan od dokumenata EU koji se odnose na područje zaštite prirode i okoliša je Uredba o nitratima (tzv. »Nitratna direktiva«) koja propisuje uvjete i primjene gnoja životinjskog porijekla, način i trajanje  njegova skladištenja u vodonepropusnim bazenima odgovarajućeg kapaciteta. Ulaskom Republike Hrvatske u EU, poštivanje dobre poljoprivredne i okolišne prakse i za naše će proizvođače uskoro postati preduvjet za ostvarivanje poticaja.

Međimurska županija nastoji se prilagoditi i približiti uvjetima u zemljama EU, uvodeći mjere vezane uz zaštitu okoliša i prirode, pa je tako Odlukom o subvencioniranju poljoprivrede u 2009. godini uvršteno i financiranje projektne dokumentacije za subvencije za ishođenje dokumentacije za izgradnju vodonepropusnog skladišnog prostora za organska gnojiva na stočnim farmama. Subvencija se dodjeljuje poljoprivrednom gospodarstvu za sufinanciranje troškova izrade projekata, izdavanja rješenja o uvjetima građenja ili lokacijske dozvole, potvrde glavnog projekta, komunalnog i vodnog doprinosa, plaćenih u tekućoj godini. Subvencija se isplaćuje u iznosu 50% od ukupnih dokumentiranih troškova.